mrt.exe už je tu s námi pár let... instaluje a spouští se v rámci aktualizací každý měsíc.
Dočasný adresář v rootu zůstal nesmazán nejspíš proto, že se něco nekorektního stalo v průběhu instalace, buď vinou programu samého, nebo že ses jej pokusil násilně ukončit (nebo proces installeru který ho spouští).
Vytížení procesoru na 100% u jakéhokoliv programu instalovaného přes Windows Installer není nic divného.