Nechápu. Jak si někdo může zasvinit LAN takovým šitem jako je Hamachi? Takové věci se přece řeší VPN routovaným PtP spojením ze serveru/routeru.

Tvůj problém je způsoben pravděpodobně:
1) špatným nastavením browsemastera v síti (podle tvých dotazů tam máš sambu jako doménový kontrolér, pak je třeba zvýšit v smb.conf globální položku OS level, tak aby se samba stala vždy BM, nezávisle na výkonu a uptime ostatních stanic v síti

2) problémy s LAN (pravděpodobnější) - viz odstavec o Hamachi. Hamachi je pro domácí lamy co si chtějí hrát gamesky, rozhodně to není nástroj na firemní použití a ten kdo to tam nasadil, tomu by patřilo pozurážet pracky a k IT už do konce života nepouštět.