všechny - prakticky všechno to jsou blbosti od lidí, kteří by neměli mít administrátorská práva ani k automatické pračce.
dnes už se častěji malware hledá anispywarem než antivirem. nebo jde o tvůj případ 50 automaticky spouštěných nesmyslů z registrů. zkus aspoň odhadnout co může mít význam ve firmě, ale když jsou všichni admoši, jistě si to zapnou sami :)
ještě jedno místo bych zkontroloval - parazitní bho doplňky v prohlížeči: ie - nástroje - spravovat doplňky - vypnout.

ps: pomalý start originálně vytuněné firemní istalace, se všemi skripty, přepsáním registrů a stažením profilu trvá asi 3-5 minut když se dobře daří (tímto zdravím náš megafiremní it-crowd:)