To je divne, ja by som skusil novu instalaciu Win, nejak ti to asi acronis posral (dovod moze byt to "jen po rozdeleni mensi oddil C:" mozno boli pouzite clustery aj nad hranicou noveho C: a acronis nezvladol preusnut tie clustery na nizsie miesta). Inac skus acronisom nie kopiu oddielu (vtedy kopiruje asi len podla neho pouzite clustery), ale skus strcit do PC obe HDD a urob kopiu komplet vsetkych sektorov disku (neviem ci to vie acronis, ak nie acronis tak niektory tool napr. z "ultimate boot CD" by to mal vediet). Vola sa to zvycajne image/kopia disku, nie oddielu.
Ak bootujes Win zo stareho disku, tak tam to funguje?

P.S. prip. skus na novom disku urobit C: tak isto velke ako na starom disku, a preplacni to nanovo tym image particie. Alebo na starom disku najprv chkdsk, prip. aj defragmentovat, a az potom urobit image oddielu a dat na novy disk.