Protože messenger je pouza část služeb facebooku. Proto se postupuje tak, že si založíš účet na facebooku a ten zadáš v messengeru.
Je to podobné, jako bys chtěl používat např. google drive bez účtu na google.
Profil na FB si můžeš skrýt, nemusí být viditelný nikomu, ani vyhledávačům. Ale počítej s tím, že lidé, kterým budeš psát budou u tebe v přátelích a jestli si to pořádně nenastavíš, tak tě uvidí jejich přátelé v přátelích atd...