Na Linuxu fungují bez obav všechny formáty (flashdisku) včetně exFAT a NTFS. Kdyby náhodou ne, doinstalovat balíček fuse-exfat do Linuxu. Nebude-li flashka používána na Windows, jen na Linuxu, doporučuji jí naformátovat na ext4 pod Linuxem, třeba programem GParted.