pokud to tak činí i přes skutečnost, že systém i FTP byly řádně nainstalovány, tak bych měl být na eventuelní problém upozorněn nějakým chybovým hlášením

Když by sis prošel pár ruských FTP, zjistil bys, že takových chyb je fůra:
FTP vyjede list a při kliknutí na nějaký dir slavnostně hlásí že není (netrefil, netrefil )
Timeout snad víš co znamená
Moc hezký chyby jsou třeba v kódování názvu...
---
Filezilla má taky hezký log.
Podporuje ftp server navázání přerušeného spojení (při přerušení)? - vyzkoušej flash get
Jiný počítač s jiným připojením. je v pořádku?
Lze se kouknout do logu ftp serveru? Server určitě nebude vykládat klientu, že má takový a makový bezpečnostní nastavení.
Problém vyvstane v načítání adresáře s miliony souborů, nebo ve stahování milionu souborů? (pokud druhý- v ftp klientu dej soubory do fronty a stahuj po jednom - i tak se problém vyskytne?)