Na SSD sa defragmentácia neodporúča. Nie je to magnetický zápis (ako na HDD), kedy hlavička pri fragmentovanom disku musí lietať hore-dole po platniach. Defragmentovaním HDD sa jednotlivé časti prskúpia tak, aby hlavička čítala kontinuálne a nelietala po disku. V SSD sa zapisuje do pamäťových buniek s omnoho rýchlejším prístupom a teda je jedno, v ktorej bunke je tá ktorá časť súboru uložená.