Hodně hodně dobrý je MediaCoder free, nevzpomínám si, zda je čeština v menu
nebo jsem si ji stáhnul z jejich stránky, to už pořešíš sám.

http://www.slunecnice.cz/sw/mediacoder/

Samozřejmě je tam volba Split a Join.
Na tyhle volby používám s úspěchem mnohem jednodušší softy od Boilsoftu,
jsou na pár dní zadarmo a vynikají jednoduchostí:

http://www.boilsoft.com/avi-mpeg-rm-joiner.html

http://www.boilsoft.com/videosplitter/

Ovšem pokud narazíš na složené problémové třeba MPG, které se tváří konzistentně,
tak ani boha ti nepomůžou VirtualDuby atd, musíš to překódovat
a zapomeň za VD nebo VDM nebo ostatní freewary, je třeba použít Mediacoder,
ten to zmákne. Je to zřídka, ale stává se to.
Tip: při překódování videa se ti za pár sekund objeví, že je hotovo 100%,
ale sleduj vpravo v panelu hodnotu Pozice. Má-li film 20 minut,
tak vyčkej, až hodnota Pozice doskáče na 20 minut, i když 100% se objeví za 5 minut.