Je mi záhadou souvislost neznalosti hesla a spuštění Windows v nouzovém režimu...

Ještě si můžeš vytvořit bootovací USB flash a spustit to z něj. Ale protože BOINC je zcela legální SW, pravděpodobně jej tyto programy neberou jako nákazu. Předpokládám, že sis ten program nainstaloval dobrovolně -pak bys ho měl vidět v seznamu nainstalovaných programů a měl bys ho normálně odinstalovat. Pokud to nepůjde, zkus BOINC Uninstall Clean Up Utility.