Je to podobný ozdíl jako když si fotku uložíš v BMP (formát bez komprese) nebo JPG (formát se ztrátovou kompresí).
Jednak je rozdíl je v kompresi videa a druhak je rozdíl ve velikosti obrazu. Film určitě nemáš v rozlišení 1024x768 a víc.

Pro změnšení velikosti budeš muset prohnat nahrané video nějakým programem, který provede příslušnou kompresi (VirtualDub, Media Coder, Movie Maker, ...), pokud to neumí nastavit Fraps přímo, aby použil na ukládání nějaký kodek.