Takže uvedl by mě někdo do světa NAS a vysvětlil mi, která značka je nejspolehlivější? Synology, QNAP?

To se asi dá těžko tak říct, nejspíš nejčasteji odejdou disky uvnitř. A ty už si v případě "dospělého" řešení vybíráš sám.

Kam můžu zasadit (pokud to jde) moje WD disky atd. atd.?

Jestli myslíš ty disky z toho NAS od WD tak možná se musí přelepit nějaké piny, nevím přesně jaké.
Ten WD se teď přehřívá proč ? Zdechl tam ventilátor ?

Nespíš bych koupil novou nas+ nové disky a překopíroval obsah té staré. Potom bych u staré vyřešil to chlazení.
Disky bych už tam nechal dožít.