popravde ti vôbec nerozumiem, ale ak som pochopil správne tak problém je že dáš skopírovať súbor na USB flashku, tú odpojíš, pozdejšie pripojíš a namiesto súboru tam vidíš len odkaz na súbor, avšak samotný súbor na flashke nie je?
Skúšal si flashku aj v inom počítači? Alebo inú flashku v notebooku?

E: Môžeš do notebooku stiahnut MBAM + ADWCleaner. Prípadne spusti aj nástroj zvaný "mrt.exe", teda ak v notebooku máš Windows čo tiež nepíšeš.