Obecné univerzální řešení jsem ti napsal v předchozím příspěvku, konkrétně je to druhý odstavec.
Co se týče toho, co jsi nepochopil, tak pokud autor nabízí program jako instalačku v podobě exe, tak prostě zjistíš co je to za exe. Například pokud se jedná o inno setup instalátor (často používaný, např. jej používá MPC-HC), tak prostě to exe dekompiluješ pomocí innounp a získáš tím soubory programu a instalační skript (obvykle není problém, pokud tam není Pascal), který můžeš upravit (pokud pude provést úprava, kterou potřebuješ) a poté zkompilovat pomocí inno setup. Nebo si místo toho třeba uděláš cmd instalátor (jako kopírování souborů, zápisy v registru atd.) nebo použiješ cokoliv jiného na instalaci. Pokud se jedná o něco, co dekompilovat nejde, tak ten program prostě nainstaluješ do prostředí (třeba ve virtuálce), do kterého jej chceš instalovat, a ty prostředí před a po instalaci porovnáš, získáš tím to, co provádí instalátor a to pak můžeš provádět sám způsobem jaký chceš. To máš jen něco, prostě se musí postupovat konrétně podle toho, oč se jedná.