No, tak si to shrňme:

a1) Potřebuješ MS Exchange
b1) Nepotřebuješ MS Exchange, můžeš přejít na Linux (v takovém případě jakýkoliv, viz thready "jaký linux na server)

a2) Takže potřebuješ MS Exchange a navíc Mobile Services. Ujišťuji tě v takovém případě, že na nový Exchange přecházet nechceš (věř mi). :) SBS 2003 můžeš provozovat ještě roky (znám firmy kde běží dodnes kombinace Linux Samba kontroler + member server Exchange 5.5). A vcelku bez virů (myšleno na serveru; poštou viry chodí, pochopitelně, to je pak záležitost antiviru pro Exchange). Je to tím, že na tom serveru nikdo viry nepouští.

b2) budeš potřebovat člověka co by ti linux spravoval a navíc nebudeš synchronizovat žádné mobilní zařízení. To zní výhodně...

Myslím, že jádro problému je ten trojan(?), ale za ten z 99% Windows nemůžou a z 100% by ti nové Windows od něho nepomohly.