Nedělej to "ručně", není to tak jednoduché ...

Prostě ten oddíl na HDD zmenši (ve Windows nebo přes Gparted) tak, aby to "vlezlo" na SSD a pak normálně klonuj (Macrium, Aomei, EaseUS, Acronis, origo program k SSD). Možná začni promazáním a komprimací toho oddílu/disku.

Macrium či Aomei to možná umí i bez zmenšení.