Asi nejlepší řešení je doplněk Foxmarks: https://addons.mozilla.org/cs/firefox/addon/2410 synchronizuje záložky se serverem (je možno i s vlastním) a tak jsou záložky kdekoliv k dispozici. Jinak je v knihovně stránek (ctrl+shift+b) možnost si záložky lokálně vyexportovat...