zkus spustit:

notepad c:\boot.ini

a obsah sem zkopírovat přes schránku. v biosu by mělo být nastavitelné, který disk bere jako první=bootovací; zkontroluj že je to tvůj ide.
ať se vyhneš předcpávání jiných primárních oddílů před svůj systémový disk, bylo by lepší kdyby tvůj datový sata disk neměl primární oddíl, ale jen extended. nějaký partition manager by to měl umět převést i bez ztráty dat.