Jo to zvládá, ale pokud vím, tak jen číst a ne vytvářet. Vytvořit umí jen big floppy. Možná jde právě o tohle.
Víc partition na flešce zvládaly win9x (byť se v nich s fleškou zacházelo dost blbě) a mám pocit že i dvoulitry, ale XP (Visty, sedmičky) už ne. Linux to naopak zvládá bez problémů a osobně bych doporučil na tohle ho použít, vystačí se s nástroji, které jsou ve všech distribucích už nainstalované.
Ve windows se mi osvědčil HDDGURU Raw Copy Tool