Fakt tam byl nějaký zádrhel, řešilo se to i myslím na fóru na webu toho programu. Muselo se to nějak složitě obejít - označit všechny složky v rootu a vyjmout ty co nechceš zálohovat. Nebo byl myslím problém s tím, že složka musela na cílovém disku existovat, jinak to nefungovalo.