Esata je jen sata s redukcí, počítač nic nepozná a bude se chovat jako by jsi měl v počítači dva sata disky.Stačí pak v biosu nastavit že se má bootovat z toho druhého
http://www.100mega.cz/product.jsp?artno=DOPK1911

Co se týká toho připojování a odpojování za chodu (pokud by jsi samozřejmě v tu chvíli z něho nebootoval) tak i když nemáš nastavený ahci režim tak většinou stačí disk připojit a ve správci zařízení dát aktualizovat hardware. Před odpojením v něm disk jednoduše zakážeš. Podobně to jde i s pata disky