Řešení od AI existuje. Potřebuješ plugin, který dělá pouze „virtuální pořádek“ v mediální knihovně WordPressu, tedy:
– nijak fyzicky nepřesouvá soubory na serveru
– nemění URL médií
– nepřepisuje originální Media Library
– funguje s Gutenbergem

Tyto pluginy to splňují:

1. FileBird – Media Library Folders
– vytváří pouze virtuální složky v administraci
– fyzická struktura /uploads zůstává beze změny
– Gutenberg funguje bez zásahu (nemusí být nainstalovaný)
– vhodné i pro hodně velké knihovny
– nejčastější volba přesně pro tento problém

2. Real Media Library (Lite)
– virtuální složky a kolekce
– žádné změny cest k souborům
– kompatibilní s Gutenbergem
– pozor jen na pokročilé volby v PRO verzi (tam už lze hýbat fyzicky se soubory, ale není povinné)

3. Media Library Organizer
– spíš „organizační nástroj“ než správce adresářů
– třídění, filtry, taxonomie
– nic nepřesouvá na disku
– velmi bezpečné řešení, pokud chceš hlavně přehled

Co výslovně NEDOPORUČUJI bez hlubší kontroly nastavení:
– WP Media Folder (umí fyzicky měnit strukturu, vysoké riziko rozbití webu, pokud se přehlédne volba)
– pluginy, které slibují „real folders on server“

Doporučený postup:
– kompletní záloha webu
– nainstalovat FileBird (free)
– nejdřív vytvořit prázdné složky
– postupně jen přiřazovat existující média do složek (bez přesouvání na serveru)
– po každém kroku ověřit starší obsah v editoru

filebird
real-media-library-lite
media-library-organizer

Shrnutí:
Pokud chceš maximální bezpečí, žádný rozpad webu, začni FileBirdem. Je přesně dělaný na tenhle scénář, který popisuješ. Je to dlouhé, ale třeba to bude pro tebe vyhovující řešení.