Ještě bývala možnost rozšiřovacích slotů PCMCIA a ExpressCard, paralelní port v nich byl jako fyzický, u sériového bych čekal totéž. Ale ani to se dávno nedělá. Nevím jak dlouho to notebooky nemají. Ale tyhle karty by měly snad dostat přidělenou adresu biosem a měly by v dosu teda normálně fungovat.
Sériový port jsem měl u starého notebooku, ale to je 15 roků (už třetím rokem mám nový). U stolních počítačů se pořád ještě dělá, u notebooků už dávno ne.
Pokud bootojete z CD, tak umřelý disk je to nejmenší. To spíš by měla fungovat baterka, což u starého ntb bude větší problém.
Pro ty virtuální porty nejde sehnat dosový ovladač? Jen se ptám, nikdy jsem to nezkoušel, pamatuju že i ve windows 95 s tím byly nějaké problémy. Ale jinak pro komunikaci bývaly v pohodě (někdy se musela zakázat FIFO). To programování EEPROM bude trochu problematičtější, tam asi nebude sériový protokol (bývá to SPI nebo IIC), ale nějaký jiný režim portu a to bude jádro problému.
Na programování (hlavně AVR ale Eeprom uměl taky) jsem používal ponny prog https://www.lancos.com/prog.html fungoval ve windows i v linuxu i na paralelních portech mimo dosah klasického biosu (ale paralelní porty přes USB jsem nezkoušel). V sedmičkách se muselo něco doinstalovávat kvůli přístupu na port. V linuxu se musela nějak nastavovat práva. Už jsem s tím dávno neexperimentoval. Pamatuju že když se připojoval programátor přes USB musela se o řád snížit rychlost proti paralelnímu portu, ono USB je rychlejší pokud jde o přenos, ale je tam větší prodleva než na těhle klasických portech. Ale to bylo úplně jiné programování něčeho úplně jiného, jinak se mi USB zatím dařilo vyhybat (nepočítám bootloader arduina, ale to je obyčejná sériová komunikace, žádné speciality typu emulace SPI na sériovém nebo paralelním portu).

Napadá mě co raspberrypi a dosbox, nešlo by to tam? Nevím jak to má se sériovým portem, jestli ho emuluje korektně. Ale předpokládám že nějaký nástavec pro převod těch třívoltových úrovní na RS232c existuje. Jinak nějaké to minipc by taky šlo. Pokud by to byl model napájený 12V (takové MB se dělaly). A patřičný displej taky napájený z baterky. Rpi si pamatuju, že mi chodilo celý den (teda jako od rána do večera) i s pětipalcovým displejem z powerbanky 10Ah.