V Ubuntu na to máš program GParted: http://www.linuxexpres.cz/uploads/gallery/detail/5 41.jpg Linux žádné C: a D: neužívá, nejdřív se podívej v Ubuntu, jak to máš rozdělený- bude tam určitě i swap. Takže formátovat nic nemusíš, v Gparted můžeš měnit velikost oddílů, formátovat , přesouvat...
Nejjednodušší je oddíl pro Ubuntu nevytvářet před instalací, ale použít nabídku: použít volné místo na disku- Ubuntu instalační program sám rozvrhne disk, vytvoří home a swap oddíl.http://www.linuxexpres.cz/praxe/pruvodce-linuxem-7 -instalujeme-linuxovou-distribuci