Pouhá defragmentace je slepení trosek, ve kterých je soubor roztroušen po disku na jeden souvislý celek. Jako když dáme za sebe všechny stejnobarevné kostky ve stavebnici. Tak funguje defragmentace od M$, co je zamontovaná ve Windows. Spousta dalších programů se snaží být lepší a třeba rovná soubory ještě podle četnosti použití, do kterých se nezapisovalo dává na začátek a podobně. U analogie kostek srovnavá kostky ještě podle velikosti, podle pořadí barev ve spektru atd. Proto každý program defragmentuje prakticky jinak, u těch nejlepších lze způsob defragmentace nastavit.