používáte každý svůj vlastní účet, ať máte svoji plochu a svoje nastavení, nebo jediné přihlášení?
jinak nedává smysl že by ti druhý člověk měnil tvoje nastavení.
v ovládacích panelech - ie - záložka programy - zruš "pokud není ie výchozí, zobrazit oznámení"

přihlášení má mít každý uživatel svoje, ať se vyhnou konfliktům v nastavení programů a ukládáním dat. ve windows to použitelně funguje od win2000.