a co jste vyřešili? a zaviroval to kdo?
jestliže jsou zavirované adreáře na linuxu - pak asi neběží vir na linuxu, ale jsou zavirované sambou nasdílené adresáře ze strany pc stanic.
už to máte odvirované?
autorun máte konečně zakázaný?

jinak je pravdou že server jsem předpokládal ve firmě, školní sítě pracují na obou stranách s tím nejhorším materiálem.