Prehliadače nezvládajú CDATA pri text/html (http://juicystudio.com/mimetest/cdatacomment.php).
Najjednoduchšie asi bude zakódovať skript do HTML (nahradiť špeciálne znaky entitami) a môžeš to aj obaliť komentárom:
<script type="text"/javascript"><!--
skript
//--></script>