Dělalo mi to úplně to samé. Vyřešil jsem to následovně: Nástroje - Možnosti - Aplikace a tam jsem vymazal vše, co se týká Acrobatu a PDF. Teď se mi PDF soubory stahují normálně jako ostatní soubory - možnost buď otevřít nebo uložit (neotvírají se přímo ve FF).