Co si preboha nastavil ako "secondary"??? Secondary znamena druhy ATA konektor. A nie nejake nastavovanie.
Prepojku disku nastavis na MASTER ked je sam na kabli, zapojis ho na koniec kabla, 80ziloveho kabla, a v BIOSe nechas automaticku detekciu.

Potom si v BIOSe nastavis z ktoreho disku sa ma bootovat a save & exit.

P.S: pri instalacii Win ten PATA odpoj aby bol SATA ako C: Po instalacii Win mozes pripojit PATA, vo Windows ostane C: navzdy ten disk na ktory bol Win nainstalovany, takze SATA (predpokladam ze mas aspon Win2000 a nie nejaky Win9x)