ntldr: v nt4/w2000/xp je, liší se podle servicepacku - zvláště v případech kdy ms zvětšoval podporu pro maximální velikost bootovacího oddílu - ntldr nebyly kompatibilní.

bootsektor: co tuším, obsahuje jména bootovacích souborů které se mají vyhledat a zavést (iosys, msdos.sys, ibmpc.sys, ... ntldr, + název filesystému, + chybové hlášení když se na bootovacím oddílu boot-soubory nenajdou)
co tam zapisuje linux formátující na fat/fat32 - asi něco podobného, vodoznak ms pochopitelně není povinný.

zdejší odkazy nečtu, anglicky neumím, tak nevím jestli to tu někde bylo zmíněno.