Já zatím nemíval problém s instalací Windows na stejný disk vedle staré instalace- instalátor to zná a nabídne instalaci do nové složky a její pojmenování. Původní složku Windows a Program Files pak po instalaci přejmenuj a když to bude v pohodě, tak po čase smaž. Nakonec uprav boot.ini , aby ti nenabíhala nabídka výběru systému.