Po instalaci OS se ovladače instalují na systémový disk anebo na datový?.

systémový

Také antivir a firewall už budu dávat na datový disk.

dle mě šílenost.V případě že druhej disk odpojíš nebo klekne nemusí najet ani systém.

Akorát si tím přidáš práci, budeš muset přesměrovávat každý instalovaný program na druhý disk a stejně se něco uloží do adresáře windows.
Maximálně bych změnil umístění "documnet and settings" případně hry instaloval na druhý disk. Je možné taky swap nastavit na druhý disk.A to je dle mě vše co má smysl.