Ty mas tedy problemy... Ani ti to nezavidim.
Tento pozadavek bych resil v zavislosti na poctu opakovani a casovych propoctu. Pokud je to jedinecne, udelal bych to rucne, pokud to ma byt vyuzito pravidelne, napsal bych programek v C apod. Jde jen o to, kopirovat znaky do nasledujiciho znaku po konci radku a prejit na druhy soubor a opakovat... Osobne by mi napsani tohoto programku trvalo 1-2h (nejsem programator), takze to by byla rozhodovaci mez.