Přeinstalací, tak jak jsi ji zkoušel nic nevyřešíš- balast ti zůstane. Pujč, nebo si udělej instalační CD se servicepacky, zazálohuj si vše, co nechceš smazat a spusť instalaci z CD, ne z Windows. Až se ti objeví nabídka, kam chceš instalovat, odstraň oddíl s Windows a dej vytvořit nový a zformátuj NTFS. Takhle budeš instalovat na čistý oddíl. Rozdělený disk bych nechal a neslučoval.