Děkuju za nápady. Možné řešení je nainstalovat Thunderbird, označit emaily které se mají vytisknout a dát tisk. Pak se všechny označené emaily hodí do fronty k tisku.
Nebo pomocí programu na http://www.mail-print.com/ rovnou tisknout nebo uložit od *eml, automaticky se číslují a pak pomocí příkazu copy *.eml vse.txt hodit to jednoho souboru. Bohužel formátování a čeština je nic moc.