řekl bych, že kdo by to vymyslel, tak dostane metál.

problém je ve špatný, nebo špatně detekovaný snímkový frekvenci (fps) videa, pokud se zvuk rozjíždí stylem: začátek ok, půlka filmu třeba 2 vteřiny, konec 4 vteřiny. většinou se laboruje s fps ne s audiem
druhým druhem je konstantně posunutý zvuk - tam si extrahuj audio třeba do audacity, no i ten avidemux má měřidla, a mrkni se jaký má posun (než zazní zvuk, když otevře klapačku) v ms.

zagoogluj na tenhle způsob, o automatu nevím, ale třeba se mýlím.
Avidemux měřidlo

Audacity měřidlo