V čem shledáváš tu neřešitelnost? Ukládání do rozdílných složek problém není, vyhledání duplikátů problém není, porovnání také ne (to je IMHO proveditelné i přes .bat soubor), nastavení přístupových práv mají snad všechny Linuxy a verze Windows, které jsou vyšší než Home / Home Premium (tj. třeba XP Professional, nevím, jak je to u sedmiček), i do Home verze Windows se dá zjednodušená správa přístupových práv "doinstalovat". Verze Home a Professional se od sebe liší jediným klíčem v registru (nenabádám, aby si to někdo změnil - je to nelegální) .