nakonec jsem nemusel žádný data přesouvat, žádný poškozený soubory vyhledávat a kopírovat jinam. na úplným začátku stačilo použít tento postup :

http://support.microsoft.com/kb/315265/sk

po něm mi to napsalo hlášku, že nalezl chyby v systému souborů a tak jsem je dal na tom externím disku opravit. a všechny ztracené složky na exteru už jsou na svém místě a vše odpovídá velikosti využití místa na disku. i tak vám všem děkuji za snahu a pomoc