Podle toho co si pamatuju máš pravdu. FT převádí signál z časové oblasti do frekvenční. FFT je "rychlou" implementací FT; zřejmě musí být splněny určitý podmínky.
Jinak obecně při vzorkování se musí dodržet vzorkovací (Shannon-Kotelnikuv) teorém; vzorkovací frekvence musí být dvojnásobkem (teoreticky) maximální frekvence obsažené v signálu (prakticky tak čtyřnásobkem).
Pavel