O jaké Windows se jedná? XP?
Ty mají v souboru boot.ini přepínač /maxmem=xx, kterým se dá omezit velikost používané paměti. Není to asi úplně ono, co potřebuješ, ale pokud máš vadné bloky někde na konci, možná...
http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb%3 Bcs%3B833721#XSLTH3173121121120121120120