ad 1) zřejmě máš po instalaci vypnutou službu schedule/plánovač úloh. Dělá to třeba instalace SP2 Zkontroluj toto nastavení v services.msc

ad 2) asi to normální je, protože za a) mě to dělá taky a za bé) "průvodce" prochází celým systémem a skenuje, co vše Ti může nabídnout. Čím bohatší windows, tím to bude trvat déle. Ale možná to závisí i na něčem jiném.

ad 3) Pokud budeš vypínat PC pomocí příkazu

shutdown

-a