Po nakopírování složek se Slaxem na flash je nutno spustit soubor /boot/bootinst.bat (pokud se to dělá z Windows) nebo bootinst.sh (pokud se to dělá z prostředí Linuxu).

od toho okamžik je flash disk bootovací.

Otázkou zůstává, zda jeho hardware umí bootovat z USB. Podle dotazu usuzuji, že tazatel toho o Linuxu moc neví. Z dotazu ani z proběhlé diskuze není jasné, co vlastně tazatel udělal pro to, aby USB Flash učinil bootovací.
Slax s úspěchem používám (používal jsem) a jediný problém nastal, když si Windows "něco" zapsaly do jeho boot sektoru, potom stačilo jen obnovit bootování výše uvedeným způsobem.