No to môže byť pre "rôzne softy" (ala video joiner) aj veľký problém ak:
1. Tie videá majú rôzny pomer strán/veľkosť
2. Majú rôzny bitrate
3. Sú kódované rôznymi kodekmi
4. Obsahujú zvukovú stopu v inom formáte
atď...

Už dlho som také niečo nemal potrebu robiť - čiže nepoznám "najnovší trend" programov - možno to dokážu...
Ale ako riešenie v prípade, že je to tak ako píšem vyššie, je použiť Avisynth ! ("Frame server" - Google napovie o čo ide..)
Ten je na také hrátky ako stvorený...