zálohovat celý (nerozdělený) disk systém + aplikace + data nemá žádný smysl. data proto patří na vlastní logický/fyzický disk.
v případě poruchy je pak jednoduché obětovat celý systém, zrušit jeho defektní oddíl a buď obnovit systém ze zálohy, nebo ho nainstalovat znovu, ale všechna data zůstanou.
pokud máš obvyklé stupidní uspořádání že disk není rozdělen a data jsou v různých obskurních podsložkách dohromady se systémem, je jednodušší systémovi přikoupit vlastní disk - a nainstalovat jej znovu.