Nie osobne nastavenia ale nejake celosystemove veci si programy ukladaju do HKLM. Napr. zadany spravny instalacny kluc (alebo nejaky hash z neho) plati pre cely system, nemusi kazdy novy user zadavat nanovo CD key. Apod.

P.S. teraz som si pozrel HKLM\Software, no co si tam ti ludia ukladaju, to snad ani nie su ludia :) Ale najviac bordelu je tam aj tak pod \Microsoft :D