Programování je hlavně o hledání. Tady něco pro inspiraci, nejvíc se naučíš tím, že to zkusíš udělat sám:
http://stackoverflow.com/questions/4089613/tree-co mment-system-how-to-make
http://www.phpfreaks.com/forums/mysql-help/making- a-mysql-(kind-of-tree)-comment-system-how-to-setup/
A tady něco hotovýho:
http://www.hawkee.com/snippet/1800/