Rozdíl samozřejmě je - v přenosové rychlosti, a to přesně dvojnásobný. Tedy žádný pokles o 10% nebo 20% !!! Nesprávným kabelem se rychlost degraduje o "jednu třídu" - tedy ze SATA3 na SATA2, případně ze SATA2 na SATA. A samozřejmě - pokud budete zastávat názor, že SATA3 kabely jsou jen marketingový trik, tak si snadno uděláte ze SATA3 "obyčejnou" SATu a zbrzdíte si to na čtvrtinu.
Sám jsem se o tom přesvědčil v okamžiku, kdy mi na stole ležely dva stejně zbarvené SATA kabely a já se najednou divil, proč mi disk, který jel včera tak rychle jede najednou dnes jako s hnojem. Praktickou zkouškou jsem si rychle zjistil, že se mi pomíchaly různé (leč stejně zbarvené) kábly a od té doby si na to dávám set sakra pozor !

A jak ty kábly od sebe rozeznat? nebo v čem se jejich konstrukce liší?
Lituji - nevím.
Ale je to patrně podobné, jako u twist káblů pro počítačové sítě - žádný rozdíl na nich nevidíte, ale jsou v kategoriích Level 3-5-5e-6-7 a dosažitelná rychlost tomu samozřejmě také odpovídá.

Takže si prostě dávám pozor a hned po vybalení si SATA kábl pro jistotu fixkou označím.

Další informace na téma KÁBLY - KONEKTORY a další najdete na http://www.hd.cz/rady/poradna.php