Správa disků ho nevidí a v biosu myslim, že je pouze jeden.

Luďku, to co nevidí BIOS, neuvidí nikdo. Nainstaluj si nějaký disk manažér např. Partition magic a podívej se, jestli jsou po něm nějaké stopy. Dále zkontroluj, jak jsou zapojeny datové a napájecí kšandy. Nejsou oba disky MASTER? A ještě - disky některých výrobců se bytostně nesnášejí. Viděl jsem PC, ve kterém si "montér" zapojil datovou kšandu PATA obráceně. Tak to projeď.