FAT32 nebo NTFS. Myslim ze je to celkem jedno - FAT32 je kompatibilnejsi (umi vice zarizeni) ale starsi, mene bezpecne a nedokaze vetsi soubory nez 4GB - coz u thle flasky nevadi, kdyz se tam vyjdou takové maximálně dva - respektive jeden vetsi ;)

Obyctejne se formatoujou na FAT32, nicméně já to mam třeba fity-fity, nekdy je vhodne prenest i vetsi soubor.